牛蒡根、莖葉、成熟果實均可入藥。其根為中藥材牛蒡根的來源，味苦、微甘，性涼，歸肺、心經，具有散風熱，消毒腫的功效，主治風熱感冒，頭痛，咳嗽，熱毒面腫，咽喉腫痛，齒齦腫痛，風濕痹痛，癰癤惡瘡，痔瘡脫肛。

其莖葉為中藥材牛蒡莖葉的來源，味苦、微甘，性涼，具有清熱除煩，消腫止痛的功效，主治風熱頭痛，心煩口干，咽喉腫痛，小便澀少，癰腫瘡癤，皮膚風癢，白屑風。

其成熟果實為中藥材牛蒡子的來源，味辛、苦，性寒，歸肺、胃經，具有疏散風熱，宣肺透疹，利咽散結，解毒消腫的功效，主治風熱咳嗽，咽嗾腫痛，斑疹不透，風疹瘙癢，瘡瘍腫毒。